Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms