Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF496Q96IT1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF496Q96IT1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms