Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms