Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms