Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms