Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms