Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
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NCOA1Q15788 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
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NCOA1Q15788 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
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NCOA1Q15788 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
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NCOA1Q15788 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
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NCOA1Q15788 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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NCOA1Q15788 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
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NCOA1Q15788 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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