Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
R3HDM1Q15032 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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