Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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