Protein–RNA interactions for Protein: Q12952

FOXL1, Forkhead box protein L1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXL1Q12952 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXL1Q12952 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXL1Q12952 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms