Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms