Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms