Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms