Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPAP53621 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPAP53621 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COPAP53621 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPAP53621 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPAP53621 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPAP53621 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPAP53621 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPAP53621 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPAP53621 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPAP53621 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPAP53621 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPAP53621 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPAP53621 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPAP53621 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
COPAP53621 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
COPAP53621 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPAP53621 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms