Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LTBRP36941 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LTBRP36941 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
LTBRP36941 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBRP36941 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBRP36941 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms