Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
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