Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
J3QRK9 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QRK9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QRK9 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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