Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms