Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms