Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms