Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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HIST2H2BEQ16778 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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HIST2H2BEQ16778 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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HIST2H2BEQ16778 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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HIST2H2BEQ16778 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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HIST2H2BEQ16778 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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HIST2H2BEQ16778 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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