Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms