Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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