Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALDH4A1P30038 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms