Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms