Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms