Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNQ3O43525 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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