Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F3O00716 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F3O00716 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F3O00716 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F3O00716 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F3O00716 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F3O00716 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F3O00716 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F3O00716 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F3O00716 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F3O00716 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F3O00716 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F3O00716 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F3O00716 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F3O00716 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F3O00716 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F3O00716 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F3O00716 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F3O00716 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F3O00716 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms