Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms