Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms