Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms