Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms