Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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