Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
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ALX1Q15699 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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