Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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