Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELAQ04206 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RELAQ04206 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RELAQ04206 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms