Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms