Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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