Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms