Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms