Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGAVP06756 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms