Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCP1A6NGW2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms