Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Top3bQ9Z321 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top3bQ9Z321 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.2 ms