Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nme4Q9WV84 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nme4Q9WV84 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nme4Q9WV84 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nme4Q9WV84 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nme4Q9WV84 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nme4Q9WV84 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nme4Q9WV84 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nme4Q9WV84 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nme4Q9WV84 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nme4Q9WV84 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nme4Q9WV84 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Nme4Q9WV84 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nme4Q9WV84 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nme4Q9WV84 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme4Q9WV84 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme4Q9WV84 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme4Q9WV84 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme4Q9WV84 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme4Q9WV84 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme4Q9WV84 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme4Q9WV84 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme4Q9WV84 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nme4Q9WV84 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nme4Q9WV84 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme4Q9WV84 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme4Q9WV84 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms