Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQJ0

Tpcn1, Two pore calcium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpcn1Q9EQJ0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Tpcn1Q9EQJ0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Tpcn1Q9EQJ0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Tpcn1Q9EQJ0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Tpcn1Q9EQJ0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Tpcn1Q9EQJ0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Tpcn1Q9EQJ0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Tpcn1Q9EQJ0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Tpcn1Q9EQJ0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,43
Tpcn1Q9EQJ0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,43
Tpcn1Q9EQJ0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23,95■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,95■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,95■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,94■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23,94■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23,94■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23,91■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23,91■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23,91■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,9■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,9■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,42
Tpcn1Q9EQJ0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23,88■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23,87■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23,87■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23,86■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,86■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,85■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,85■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23,85■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23,84■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23,83■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Tpcn1Q9EQJ0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23,82■■□□□ 1,4
Tpcn1Q9EQJ0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23,82■■□□□ 1,4
Tpcn1Q9EQJ0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Tpcn1Q9EQJ0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Tpcn1Q9EQJ0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Tpcn1Q9EQJ0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Tpcn1Q9EQJ0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Tpcn1Q9EQJ0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23,82■■□□□ 1,4
Tpcn1Q9EQJ0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Tpcn1Q9EQJ0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23,81■■□□□ 1,4
Tpcn1Q9EQJ0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23,81■■□□□ 1,4
Tpcn1Q9EQJ0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Tpcn1Q9EQJ0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Tpcn1Q9EQJ0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Tpcn1Q9EQJ0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23,81■■□□□ 1,4
Tpcn1Q9EQJ0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Tpcn1Q9EQJ0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23,8■■□□□ 1,4
Tpcn1Q9EQJ0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Tpcn1Q9EQJ0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Tpcn1Q9EQJ0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,79■■□□□ 1,4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,6 ms