Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ndufa8Q9DCJ5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndufa8Q9DCJ5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ndufa8Q9DCJ5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms