Protein–RNA interactions for Protein: Q921I2

Klhdc4, Kelch domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc4Q921I2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Klhdc4Q921I2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Klhdc4Q921I2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Klhdc4Q921I2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Klhdc4Q921I2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Klhdc4Q921I2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Klhdc4Q921I2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Klhdc4Q921I2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Klhdc4Q921I2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Klhdc4Q921I2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Klhdc4Q921I2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Klhdc4Q921I2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Klhdc4Q921I2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Klhdc4Q921I2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Klhdc4Q921I2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Klhdc4Q921I2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Klhdc4Q921I2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Klhdc4Q921I2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Klhdc4Q921I2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Klhdc4Q921I2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Klhdc4Q921I2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Klhdc4Q921I2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Klhdc4Q921I2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Klhdc4Q921I2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Klhdc4Q921I2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Klhdc4Q921I2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Klhdc4Q921I2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Klhdc4Q921I2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Klhdc4Q921I2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Klhdc4Q921I2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Klhdc4Q921I2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Klhdc4Q921I2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Klhdc4Q921I2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Klhdc4Q921I2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Klhdc4Q921I2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Klhdc4Q921I2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Klhdc4Q921I2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Klhdc4Q921I2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Klhdc4Q921I2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Klhdc4Q921I2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.6 ms