Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I1

Fntb, Protein farnesyltransferase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FntbQ8K2I1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FntbQ8K2I1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FntbQ8K2I1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FntbQ8K2I1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FntbQ8K2I1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FntbQ8K2I1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FntbQ8K2I1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FntbQ8K2I1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FntbQ8K2I1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FntbQ8K2I1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FntbQ8K2I1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FntbQ8K2I1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FntbQ8K2I1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FntbQ8K2I1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FntbQ8K2I1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FntbQ8K2I1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FntbQ8K2I1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FntbQ8K2I1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1237.8 ms