Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZS7

Hmgcll1, 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgcll1Q8JZS7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hmgcll1Q8JZS7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hmgcll1Q8JZS7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hmgcll1Q8JZS7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmgcll1Q8JZS7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmgcll1Q8JZS7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgcll1Q8JZS7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgcll1Q8JZS7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgcll1Q8JZS7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgcll1Q8JZS7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgcll1Q8JZS7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgcll1Q8JZS7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmgcll1Q8JZS7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmgcll1Q8JZS7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmgcll1Q8JZS7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmgcll1Q8JZS7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmgcll1Q8JZS7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmgcll1Q8JZS7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmgcll1Q8JZS7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmgcll1Q8JZS7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmgcll1Q8JZS7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmgcll1Q8JZS7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmgcll1Q8JZS7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmgcll1Q8JZS7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmgcll1Q8JZS7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms