Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZ81

Lrrtm3, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm3Q8BZ81 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrtm3Q8BZ81 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrtm3Q8BZ81 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrtm3Q8BZ81 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms